Si la berline peut être critiquée pour son design, la version coupé est à considérer comme un exemple de design réussi, dans sa catégorie et son époque.La Lancia Flavia coupé a été présentée lors du Salon de l'Automobile de Turin 1961 et est l'oeuvre de Pininfarina. 

Avec un style typiquement italien en 3 volumes et son pavillon incliné à la ligne basse et épurée, le coupé Flavia, assume le rôle laissé par le coupé Aurelia B20.. Elle présente de fortes similitudes avec la Ferrari 250 GT de Pininfarina et elle était un parfait exemple de fusion élégance et sportivité sans excès tout en ayant une personnalité forte.

La mécanique était strictement dérivée de celle de la berline, donc avant-gardiste pour l'époque avec quelques différences de puissance. La version originale du coupé hérite du même moteur que pour la berline mais elle a de nouveaux carburateurs Solex qui permettent de pousser la puissance à 90 ch. Ce moteur permet une vitesse de pointe à 170 km/h.

La commercialisation n'a commencé qu'en juillet 1962 et a pris fin en 1964 après que 3 725 exemplaires eurent été produits. De cette version ont été critiqués la carburation, difficile à régler finement, et le couple, exprimé à haut régime.