La Boxster Type 987, deuxième génération du roadster, est présentée au Mondial de l'automobile de Paris 2004 et commercialisée à partir de 2005. Elle apparaîtra en version reliftée en 2009 avec de nouvelles motorisations. Si elle est très proche de l'ancien modèle, elle s'en différencie par ses flancs moins concaves, un aileron escamotable redessiné, des prises d'air latérales plus grandes et un arrière légèrement plus large. Malgré une grande ressemblance apparente avec son prédécesseur, la Boxster Type 987 dispose à 80 % de nouvelles pièces et aucun élément de carrosserie commun. Les feux avant abandonnent la forme si spécifique du 986, ils sont maintenant plus ronds tout en étant proches de ceux de la Carrera GT. Les jantes sont disponibles jusqu'en 19 pouces. La version S a droit à une ouverture supplémentaire à l'avant, tout en longueur et en forme de rectangle arrondi. Des améliorations sont à noter au niveau de l'habitacle, avec une meilleure finition, de nouveaux sièges plus ergonomiques et une position de conduite plus ajustable. Au niveau de la sécurité, la caisse est rigidifiée et l'équipement comprend six airbags de série. Malgré les progrès techniques, la Boxster 987 est commercialisée à des prix (sans options) moindres que la 986. Les motorisations sont toujours de 2,7 L et 3,2 L au lancement de cette deuxième génération, mais les puissances sont en augmentation (respectivement 12 et 20 ch gagnés). La boîte de vitesses est une mécanique à cinq rapports, et six rapports pour la version S (disponible en option pour la Boxster). La boîte de vitesses à cinq rapports Tiptronic S qui permet de conduire en automatique ou en manuel est optionnelle, mais ses performances sont moindres que celles de la boîte mécanique, aussi bien en accélération qu'en vitesse. Ainsi motorisée et équipé de la boîte mécanique, la Boxster franchit la barre des 100 km/h en 6,2 s, la Boxster S en 5,5 s et leur vitesse maximale est de 256 km/h et 268 km/h. La consommation mixte s'établit à 9,6 L/100 km, et 10,4 L/100 km pour la S. En 2007, le moteur de la Boxster gagne 5 ch grâce au système VarioCam Plus, passant à 245 ch, comme la Cayman. La Boxster S, quant à elle, a droit à une augmentation de sa cylindrée de 0,2 L et gagne 15 ch. Avec ces modifications, la gamme des Boxster devient donc équivalente aux Cayman, en termes de puissance.
